GFPとYFPの違いは何ですか

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Anonim

NS 主な違い GFPとYFPの間は GFPは青から紫外線の範囲の光にさらされると緑色を示しますが、YFPは同じ光にさらされると黄色を示します。さらに、GFPは元々クラゲのAequorea Victoriaに由来し、YFPはGFPタンパク質の遺伝子変異体です。

GFP(緑色蛍光タンパク質)とYFP(黄色蛍光タンパク質)は2種類の蛍光タンパク質であり、青色から紫外線範囲の光にさらされると異なる色の蛍光を示します。ただし、分子生物学におけるそれらのアプリケーションは同じです。

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GFPとは

GFP(緑色蛍光タンパク質)は、クラゲ、オワンクラゲ、および他の多くの海洋生物に自然に存在する生物発光ポリペプチドタンパク質です。オワンクラゲビクトリアでは、エクオリンとして知られており、青色から紫外線までの範囲にさらされると蛍光を発します。つまり、 GFPは、青色光(475 nm)または長紫外線範囲の395 nm光を完全に吸収し、緑色光(509 nm)を放出します。

図1:オワンクラゲビクトリア

GFPタンパク質には238個のアミノ酸が含まれており、タンパク質のサイズは26.9kDaです。折りたたんでベータバレルの形になります。ここで、蛍光を発するタンパク質の部分は、主鎖原子であるSer65、Tyr66、およびGly67の共役から形成され、酸素の存在下で高度に共役した平面p-ヒドロキシベンジリデンイミダゾリノン発色団を形成します。発色団はベータバレル構造内に詰め込まれ、常磁性酸素、水双極子、またはシス-トランス異性化による消光から発色団を保護します。また、発色団と隣接する分子との非共有相互作用により、そのスペクトル特性が向上します。

図2:GFP構造

さらに、GFPは分子生物学で遺伝子発現のレポーターとして使用され、宿主生物内での外来遺伝子の発現を証明します。また、特定のタンパク質が発現される細胞内の位置を決定するために使用することができます。ここでは、目的のタンパク質がGFPと融合され、この融合タンパク質が宿主に形質転換されます。

図3:EGFP発現

ただし、野生型GFPの主な欠点は、37°C​​などの生理学的温度でのフォールディングの効率が低く、蛍光シグナルが低下するため、有効性が低下することです。また、GFPの成熟率が低いため、タンパク質は細胞内で凝集します。 Enhanced GFP(EGFP)は、野生型GFPの派生物であり、単一点突然変異(S65T)によって生成された足場に対して、37°C​​の折り畳み効率(F64L)点突然変異を持ち、蛍光、光安定性、および主要な励起ピークが488nmにシフトし、ピーク発光は509nmに保たれます。

YFPとは

YFP(黄色蛍光タンパク質)は、遺伝子変異として導入されたGFP誘導体です。実際、それはT203Y突然変異によって達成される色突然変異体です。これにより、置換されたチロシン残基と発色団の間にπ電子スタッキング相互作用が生じます。したがって、YFPは波長514 nmの緑色光を吸収し、527nmの黄色光を放出します。

図4:GFP誘導体

GFPとYFPの類似点

GFPとYFPの違い

意味

GFPは、蛍光灯の下で緑色に光り、クラゲであるAequorea Victoriaに自然に見られるタンパク質を指し、YFPは緑色蛍光タンパク質(GFP)の遺伝子変異体を指します。したがって、これがGFPとYFPの根本的な違いです。

を意味する

GFPは緑色蛍光タンパク質を表し、YFPは黄色蛍光タンパク質を表します。

UV下で色を発する

その名前が示すように、GFPとYFPの主な違いは、GFPが緑色の光を発するのに対し、YFPは黄色の光を発することです。

発生

さらに、GFPはクラゲ、オワンクラゲなどの多くの海洋生物で自然に発生しますが、YFPはGFPの遺伝子変異体です。したがって、これはGFPとYFPのもう1つの違いです。

励起ピーク

さらに、GFPの主要な励起ピークは395 nmにあり、マイナーな励起ピークは475 nmにあり、YFPの励起ピークは514nmにあります。

放出ピーク

また、GFPの発光ピークは509 nmにあり、YFPの発光ピークは527nmにあります。したがって、これはGFPとYFPの違いでもあります。

アプリケーション

結論

GFPは、クラゲのオワンクラゲに自然に存在する蛍光タンパク質です。分子生物学で発現のレポーターとして、また融合タンパク質の局在を視覚化するために使用されました。一般に、GFPは、青色を紫外線にさらすと明るい緑色の蛍光を発します。比較すると、YFPはGFPの遺伝子変異体であり、青色を紫外線にさらすと黄色の蛍光を発します。したがって、GFPとYFPの主な違いは、それらが発する蛍光の色とその起源です。

参照:

1.「緑色蛍光タンパク質(GFP)」。サーモフィッシャーサイエンティフィック、サーモフィッシャーサイエンティフィック、こちらから入手可能2。ケトラパル、アフサネ。 「GFP誘導体:CFPおよびYFP。」 News-Medical.net、News Medical、2019年1月25日、こちらから入手可能。

画像提供:

1.「Aequoreavictoria」Mnolf著–米国カリフォルニア州モントレーベイ水族館(CC BY-SA 3.0)でCommonsWikimedia経由で撮影2.「PDB1emaEBI」JawaharSwaminathanおよびEuropeanBioinformatics Institute(Publicドメイン)コモンズウィキメディア3経由。「Fgamsppategfppuncta」ZhaoA、Tsechansky M、Swaminathan J、Cook L、EllingtonADなど。 (2013)一過性にトランスフェクトされたプリン生合成酵素はストレス体を形成します。 PLoS ONE 8(2):e56203。 doi:10.1371 / journal.pone.0056203 – http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0056203(CC BY 3.0)Commons Wikimedia4経由。「174-GFPLikeProteinsGFP-likeタンパク質」DavidGoodsell著–コモンズウィキメディア経由の今月のRCSBタンパク質データバンク分子(CC BY 3.0)

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