NS 主な違い BDNAとZDNAの間には、 B-DNAは右利きですが、Z-DNAは左利きです。 さらに、B-DNAでは、コアと糖リン酸骨格を占める塩基がらせんの周辺に存在し、Z-DNAでは、糖リン酸骨格がジグザグパターンを形成します。したがって、ベースはコアと周辺に発生します。

B-DNAとZ-DNAは、自然界に存在するDNAの3つのコンフォメーションのうちの2つです。さらに、B-DNAの直径は20Åであり、1ターンあたり10残基を含み、Z-DNAの直径は18Åであり、1ターンあたり12残基を含みます。

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BDNAとは

B-DNAは、細胞内のDNAの最も一般的で、優勢なコンフォメーションです。これは、DNAがpHや塩濃度などの自然の生理学的条件下でB型で存在することを好むことを意味します。さらに、B型のDNAは、JamesWatsonとFrancisCrickによって最初に記述されました。ただし、B-DNAは、変化する条件下で他のコンフォメーションを取ります。

図1：A-、B-、およびZ-DNAの構造

さらに、B-DNAの主な特徴には、右巻き、34Åピッチ、1ターンあたり10繰り返し単位、モノヌクレオチド繰り返し単位、20Åのらせん直径などがあります。

ZDNAとは

Z-DNAは、左巻きのらせん構造とジグザグパターンを形成する糖リン酸骨格を持つDNAの別のコンフォメーションです。さらに、それはAndrewWangとAlexanderRichによって最初に記述されました。 Z-DNAは高塩濃度に反応して形成されます。 Z-DNAは、DNAを不活性に保つことができるため、遺伝子発現の調節に役割を果たします。

図2：A-、B-、およびZ-DNAのらせん軸

BDNAとZDNAの類似点

BDNAとZDNAの違い

意味

B-DNAは、鎖がらせんの軸の前部の周りで右にねじれる二重らせんDNAの典型的な形態を指します。しかし、Z-DNAは、鎖がらせんの軸の前部の周りで左にねじれる、左巻きの珍しい形の二重らせんDNAを指します。また、各らせんターンに12の塩基対があり、外面に1つの溝があります。

形成

ヘリックスセンス

B-DNAは右利きですが、Z-DNAは左利きです。したがって、これがB-DNAとZ-DNAの主な違いです。

メジャーグルーブとマイナーグルーブ

さらに、B-DNAには広くて深い主溝と狭くて深い副溝が含まれ、Z-DNAには狭くて深い主溝と広くて浅い副溝が含まれています。

ベースとバックボーン

B-DNAでは、塩基がコアを占め、糖リン酸骨格はらせんの周辺で発生しますが、Z-DNAでは、糖リン酸骨格はジグザグパターンを形成するため、塩基はコアと同様に発生します。周辺。

砂糖の残留物の向き

また、B-DNAとZ-DNAのもう1つの違いは、糖残基の向きです。 B-DNAの糖残基は方向が変化しますが、Z-DNAの糖残基は変化しません。

繰り返し単位

B-DNAの繰り返し単位はモノヌクレオチドであり、Z-DNAの繰り返し単位はジヌクレオチドです。

ターンあたりの残留物

B-DNAには1ターンあたり10残基が含まれ、Z-DNAには1ターンあたり12残基が含まれます。

繰り返し単位あたりのねじれ角

また、B-DNAの繰り返し単位あたりのねじれ角は36°ですが、Z-DNAの繰り返し単位あたりのねじれ角は60°です。

残留物あたりの上昇

B-DNAの残基あたりの上昇は3.4Åですが、Z-DNAの残基あたりの上昇は3.75Åです。

らせんピッチ

らせんピッチもB-DNAとZ-DNAの違いです。 B-DNAのらせんピッチは34Åですが、Z-DNAのらせんピッチは45Åです。

塩基対の傾き

B-DNAの塩基対の傾きは6°ですが、Z-DNAの塩基対の傾きは7°です。

繰り返し単位の回転

さらに、Ｂ－ＤＮＡの繰り返し単位の回転は３６°であり、Ｚ－ＤＮＡの繰り返し単位の回転は６０°である。

直径

B-DNAの直径は20Åですが、Z-DNAの直径は18Åです。

グリコシドねじれ角

グリコシドのねじれ角は、B-DNAのデオキシグアノシンとデオキシシチジンに対して抗であり、グリコシドのねじれ角は、Z-DNAのデオキシグアノシンとデオキシシチジンに対してsynです。

シュガーパッカー

さらに、シュガーパッカーはB-DNAのデオキシグアノシンのC2 'エンドとデオキシシチジンのC3'エンドであり、シュガーパッカーはZ-DNAのデオキシグアノシンのC3 'エンドとデオキシシチジンのC2'エンドです。

軸からのPの距離

軸からのPの距離はB-DNAのdGpCとdCpGの両方で9.0Åですが、軸からのPの距離はdGpCで8.0Å、Z-DNAのdCpGで6.9Åです。

結論

B-DNAは、細胞内で発生するDNAの一般的な形態です。それは右巻きであり、コアの塩基と周辺構造の糖リン酸骨格で構成されています。さらに、1ターンあたり10ヌクレオチドが含まれています。 DNAらせんの幅は20Åです。一方、Z-DNAは左利きであまり一般的ではない形式のDNAであり、高塩濃度で発生します。さらに、その糖リン酸骨格はジグザグパターンを示しています。また、1ターンあたり6つのジヌクレオチドが含まれています。さらに、Z-DNAの幅は18Åです。したがって、B-DNAとZ-DNAの主な違いは、らせん構造、形状、および寸法です。

参照：

1.「Z-DNA、左利きのDNAフォーム」。バイオサイクロペディア、こちらから入手できます。

画像提供：

1. Mauroesguerrotoによる「Dnaconformations」– Commons Wikimediaによる自作（CC BY-SA 4.0）2。英語版ウィキペディアのLankenauによる「B&Z&ADNAformula」–en.wikipediaからCommonsに転送。 （パブリックドメイン）コモンズウィキメディア経由