プラスミドマップは、プラスミド内の要素の相対位置です。プラスミドの特徴を理解することで、プラスミドマップを読み取ることができます。それらは、プラスミドの名前とサイズ、プラスミドの要素、それらの相対的な位置、およびプロモーターの方向です。複製起点（ORI）、抗生物質耐性遺伝子、マルチクローニングサイト（MCS）、目的のインサートまたは遺伝子、プロモーター領域、選択可能なマーカー、およびプライマー結合部位は、プラスミドの要素です。プラスミド内の要素の相対位置は、プラスミドをマッピングすることによって決定できます。プラスミドのマッピングに関与するプロセスは、制限マッピングと呼ばれます。

対象となる主要分野

1.プラスミドマップとは –定義、制限マッピング 2.プラスミドマップの読み方 –プラスミドMapPの機能

重要な用語：要素、プラスミドの名前とサイズ、プロモーターの方向、プラスミドマップ、制限酵素、制限マッピング

プラスミドマップとは

プラスミドマップは、プラスミドの主要なランドマークまたは要素の位置を示す、プラスミドのグラフィック表現です。プラスミド内の要素の相対位置は、次の方法で識別できます。 制限マッピング。制限マップは、特定のプラスミド内の制限認識部位のマップです。したがって、制限酵素によるプラスミドの消化に関与しています。制限マップを図1に示します。

図1：制限マップ

制限マッピングでは、次の2つの方法を使用できます。

1.制限消化

–1つまたは2つの制限酵素によるプラスミドの制限消化

–プラスミドから得られたフラグメントのサイズに基づいてプラスミドをマッピングする

2.シーケンス

–プラスミド全体のシーケンス

–プラスミドの要素の同定

プラスミドマップの読み方

図2：プラスミドマップ

プラスミドマップの読み取りは、主にプラスミドの特徴に焦点を当てています。彼らです;

1.プラスミドの名前とサイズ

2.プラスミドの要素 –

3.プラスミド内の要素の相対位置

4.プロモーターの向き

結論

プラスミドマップは、プラスミドの名前とサイズ、プラスミド内の要素のタイプとそれらの相対位置、プロモーターの方向など、プラスミドマップの特徴を理解することで読み取ることができます。

リファレンス：

1.「プラスミドとは」 Addgene、こちらから入手できます。

画像提供：

1. Nothingseriousによる「PDONR221マップ」–シーケンスの分析：pDONR221。 Addgene。 2016年1月24日（CC0）にコモンズウィキメディア2経由で取得。「PGEX-3Xクローニングベクター」マグナスマンスキー作–マグナスマンスキー作（CC BY-SA 3.0）コモンズウィキメディア経由