TiプラスミドとRiプラスミドの違い
目次:
主な違い–TiとRiプラスミド
アグロバクテリウム種は、高等植物にさまざまな病気を引き起こす植物病原菌です。 Ti(腫瘍誘発性)およびRi(根誘発性)プラスミドは、アグロバクテリウム種によって産生される2種類の天然プラスミドです。 TiプラスミドはAgrobacteriumtumefaciensによって生成され、RiプラスミドはAgrobacteriumrhizogenesによって生成されます。 TiプラスミドとRiプラスミドはどちらも、病原性(vir)遺伝子の助けを借りて植物ゲノムに移されるT-DNAとして知られるプラスミドDNAの一部で構成されています。 NS 主な違い TiとRiプラスミドの間は Tiプラスミドは双子葉植物の腫瘍/クラウンゴールを誘発しますが、Riプラスミドは毛状根を誘発します。植物に感染する能力があるため、TiプラスミドとRiプラスミドの両方がトランスジェニック植物を生産するためのベクターとして広く使用されています。
対象となる主要分野
1.Tiプラスミドとは –定義、構造、ベクター制作 2.Riプラスミドとは –定義、構造、ベクトル形成 3.TiプラスミドとRiプラスミドの類似点は何ですか –共通機能の概要 4.TiプラスミドとRiプラスミドの違いは何ですか –主な違いの比較
重要な用語:アグロバクテリウム種、遺伝子工学、毛状根、Riプラスミド(pRi)、T-DNA、Tiプラスミド(pTi)、腫瘍、vir遺伝子
Tiプラスミドとは
Tiプラスミドとは、アグロバクテリウム・ツメファシエンスが植物に感染し、腫瘍/クラウンゴール腫瘍を生成することを可能にするプラスミドの一種を指します。したがって、Tiプラスミドは腫瘍形成遺伝子と病原性(vir)遺伝子の両方で構成されています。 vir遺伝子は、腫瘍形成遺伝子を含むT-DNAを、切除と統合によって植物ゲノムに移す役割を果たします。典型的なTiプラスミドは、領域A(腫瘍形成に関与するT-DNA)、領域B(複製に関与する)、領域C(接合に関与する)、および領域D(病原性に関与する)の4つの領域で構成されます。 T-DNA領域の遺伝子は、植物成長ホルモン(オーキシンとアグロピン)の生成を制御し、感染した植物細胞の増殖を誘導します。 T-DNA領域の両端には、24塩基対の直接配列反復を含む境界配列が隣接しています。 T-DNAトランスファーには右ボーダーのみが不可欠です。 Tiプラスミドの構造を図1に示します。
図1:Tiプラスミド
アグロバクテリウムを介した遺伝子の形質転換では、ベクターはTi-プラスミドに基づいて設計されています。ベクターは、T-DNAボーダー配列、vir遺伝子、および修飾T-DNA領域で構成されています。 T-DNA領域の修飾中に、腫瘍形成の原因となる遺伝子が除去され、形質転換される外来遺伝子に置き換えられます。
Riプラスミドとは
Riプラスミドとは、Agrobacteriumrhizogenesが毛状根を生成することによってパンツ細胞に感染することを可能にするプラスミドの一種を指します。これは、Tr-DNAおよびT1-DNAとして知られる2つのT-DNAフラグメントで構成されています。両方のフラグメントは、15kbのDNAセグメントによって分離されています。 Tr-DNAはTiプラスミドのT-DNA領域に類似しており、成長ホルモンの産生を誘導する遺伝子を含んでいます。 T1-DNA領域は、rolA(毛状根の形成に関与)、rolB(根の開始とカルス形成を誘導)、rolC(根の成長を促進)、およびrolD(カルスの成長を抑制する)の4つの遺伝子で構成されています。 T-DNAの形質転換はvir遺伝子によって誘導されます。 Agrobacteriumrhizogenesによる毛状根の形成を図2に示します。
図2:毛状根
遺伝子工学では、TiプラスミドはほとんどRiプラスミドに置き換えられています。
TiプラスミドとRiプラスミドの類似点
TiプラスミドとRiプラスミドの違い
意味
Tiプラスミド: Tiプラスミドは、細菌が植物に感染し、腫瘍/クラウンゴール腫瘍を生成することを可能にするプラスミドの一種です。
Riプラスミド: Riプラスミドは、細菌が毛状根を生成することによって植物細胞に感染することを可能にするプラスミドの一種です。
アグロバクテリウム種の種類
Tiプラスミド: Tiプラスミドはアグロバクテリウム・ツメファシエンスによって産生されます。
Riプラスミド: RiプラスミドはAgrobacteriumrhizogenesによって生成されます。
サイズ
Tiプラスミド: Tiプラスミドのサイズは180-205kbです。
Riプラスミド: Riプラスミドのサイズは250kbです。
病気の種類
Tiプラスミド: Tiプラスミドはクラウンゴール/腫瘍の形成を誘導します。
Riプラスミド: Riプラスミドは毛状根の形成を誘導します。
研究の種類
Tiプラスミド: TiプラスミドはRiプラスミドと比較してあまり研究されていません。
Riプラスミド: Riプラスミドはよく研究されています。
結論
TiプラスミドとRiプラスミドは、異なるアグロバクテリウム種に見られる2種類のプラスミドです。 TiプラスミドとRiプラスミドはどちらもT-DNAとvir遺伝子で構成されています。 Tiプラスミドは、クラウンゴール腫瘍の形成を誘導するアグロバクテリウムツメファシエンスに見られます。 Riプラスミドは、毛状根の形成を誘導するAgrobacteriumrhizogenesに見られます。 TiプラスミドとRiプラスミドの主な違いは、各タイプのプラスミドによって引き起こされる病気のタイプです。
リファレンス:
1.「講義26:TiおよびRiプラスミド」 NPTEL、IITグワハティ、こちらから入手可能2.ハニーフ、ディーナTコチュンニジャジル「アグロバクテリウム・リゾゲネスとRiプラスミド。」こちらから入手できます。
画像提供:
1. Mouagipによる「Tiプラスミド」– Commons Wikimedia2による自作(CC0)。 FruitDefenduによる「Agrobacteriumrhizogenes」– Commons Wikimediaによる自作(CC BY-SA 3.0)
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