RAPDとRFLPの違い

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Anonim

NS 主な違い RAPDとRFLPの間は RAPDは、短いプライマーを使用して大きなテンプレート内のDNAのランダムフラグメントを増幅するタイプのPCRですが、RFLPでは、1つ以上の制限酵素がDNAサンプルを消化し、制限フラグメントを生成してからゲル電気泳動で分離します。 したがって、RADPはアッセイに少量のDNAしか必要としませんが、RFLPは大量のDNAを必要とします。さらに、RAPDは1〜10個の遺伝子座を検出できる高速プロセスですが、RFLPは1〜3個の遺伝子座しか検出できない低速プロセスです。さらに、RAPDは対立遺伝子変異を検出できませんが、RFLPは対立遺伝子変異を検出できます。

RAPD(ランダム増幅多型DNA)とRFLP(制限酵素断片長多型)は、相同DNAのバリエーションを利用して、短いDNA配列である遺伝子マーカーを検出する分子生物学の2つの手法です。

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RAPDとは

RAPDまたはランダム増幅多型DNAは、DNA変異を検出するための高速なPCRベースの方法です。 2つの研究所(Williamset。al。、1990; Welsh and McClelland、1990)が独自にこの技術を開発しました。さらに、RAPDは、多くの個別のDNA産物を増幅するために、単一の任意のプライマーを使用します。 RAPDに関連する手順は次のとおりです。

  1. DNA抽出
  2. ランダムプライマーによる増幅
  3. ゲル電気泳動とマーカーの可視化

    図1:RAPDマーカーによるレタスの多様性

さらに、得られたパターンを解決することにより、特定のDNAサンプルの半固有のDNAプロファイルを生成できます。アッセイで使用されるランダムプライマーの特異性が低いため、ランダムプライマーごとに比較的多くの遺伝子座を増幅することができます。しかし、RAPDは、遺伝子マッピング、集団遺伝学、分子進化遺伝学、動植物育種などにとって重要な手法です。さらに、速度、コスト、効率、および生成されるマーカーの数によって、初心者にとって不可欠です。

RFLPとは何ですか

RFLPまたは制限長多型は、相同DNAの変異を利用する方法です。それはまた、その識別力のためのよく知られた方法です。ただし、RFLPはPCRベースではない方法であるため、ゲノムのフラグメントの生成に制限酵素を使用します。さらに、RFLPは、個人間の制限断片の長さの違いを検出します。 RFLPに含まれる3つのステップは次のとおりです。

  1. DNAの制限消化
  2. ゲル電気泳動
  3. 特定のプローブと検出によるサザンブロッティング

    図2:RFLPによる対立遺伝子変異体の検出

RAPDとRFLPの類似点

RAPDとRFLPの違い

意味

RAPD(ランダム増幅多型DNA)は、遺伝的変異を特定するためのPCRベースの手法を指し、RFLP(制限断片長多型)は、遺伝子解析の分子的方法を指します。これにより、制限酵素切断の固有のパターンに基づいて個人を特定できます。 DNAの特定の領域。

メソッドのタイプ

方法

RAPDはランダムプライマーを使用したゲノム内の遺伝子マーカーの増幅を伴いますが、RFLPはゲノムDNAの制限消化を伴います。

DNA量

さらに、RAPDは分析に少量のDNA(10〜50 ng)を必要としますが、RFLPは比較的大量のDNA(2〜10μg)を必要とします。

種の特異性

RAPDはあらゆる種に共通のランダムプライマーを使用しますが、RFLPは異なる種特異的プローブを使用します。

効率

さらに、RAPDはステップが少なく、プロセスが高速ですが、RFLPはプロセスが遅いため、ステップが多くなります。

信頼性

RAPDの信頼性は低くなりますが、RFLPの信頼性は高くなります。

検出能力

RAPDとRFLPのもう1つの違いは、RAPDは1〜10個の遺伝子座を検出できるのに対し、RFLPは1〜3個の遺伝子座しか検出できないことです。

対立遺伝子変異体の検出

さらに、RAPDは対立遺伝子変異を検出できませんが、RFLPは対立遺伝子変異を検出できます。

重要性

RAPDは、遺伝子マッピング、集団遺伝学、分子進化遺伝学、動植物育種などにとって重要な手法ですが、RFLPは、ジェノタイピング、法医学、父性検査、遺伝性疾患のパターンの検出、および疾患キャリアの検出において重要です。 。

結論

RAPDは、ゲノムに存在する遺伝子マーカーを検出するためのPCRベースの手法です。さらに、これらのマーカーの増幅にはランダムプライマーを使用します。 RAPDはPCRベースの技術であるため、必要なDNAは少量です。さらに、これは高速な方法ですが、対立遺伝子変異を検出することはできません。対照的に、RFLPは、ゲノム内のDNA変異を検出する非PCRベースの方法です。ただし、DNAの制限消化、サザンブロッティング、および特定のプローブを使用した配列の検出を使用します。したがって、より信頼性の高い方法です。しかし、それは大量のDNAを必要とします。したがって、RAPDとRFLPの主な違いは、手順と重要性です。

参照:

1.「ランダム増幅多型DNA(RAPD)」。米国国立医学図書館の国立バイオテクノロジー情報センター、ここから入手可能2。 「制限酵素断片長多型(RFLP)」。米国国立医学図書館の国立バイオテクノロジー情報センター、こちらから入手できます。

画像提供:

1. Llull〜commonswikiによる「RAPD」の想定– Commons Wikimediaによる自身の作業(パブリックドメイン)2。Kenneth.jh.hanによる「RFLP-figure」– Commons Wikimediaによる独自の作業(CC BY-SA 3.0)

RAPDとRFLPの違い