アガロースとポリアクリルアミドの違いは何ですか
目次:
NS 主な違い アガロースとポリアクリルアミドの間はそれです アガロースは主にDNAの分離のためにアガロースゲル電気泳動(AGE)で使用されますが、ポリアクリルアミドは主にタンパク質の分離のためにポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)で使用されます。 さらに、アガロースはサイズが50〜20、000 bpのDNAフラグメントを分離できますが、ポリアクリルアミドはより高い分解能を持ち、最大5〜500bpのDNAフラグメントを分離します。さらに、アガロースゲルは水平方向にテーブル上に平らに置かれ、ポリアクリルアミドゲルは垂直方向にテーブル上に立っています。
アガロースとポリアクリルアミドは、サイズと電荷に基づいてDNA、RNA、タンパク質などの高分子を分離するために使用される2つの主要なタイプのゲルです。
アガロース、DNA、ゲル電気泳動、ポリアクリルアミド、分解能
アガロースとは
アガロースは、アガロースゲル電気泳動(AGE)で使用される天然の多糖類ポリマーです。しかし、それは分子の複雑な混合物であり、アガロースの主成分は寒天です。重要なことに、アガロースゲルでは、サイズに基づいてDNAの大きな断片を分離することが可能です。通常、DNAは負に帯電した分子であり、電界の下で正極に向かって走ります。また、アガロースゲル内部の細孔は、サイズによるDNAの分離に関与しています。
図1:アガロースゲル電気泳動
さらに、アガロースゲルは、らせん状のアガロース分子で構成された3Dマトリックスであり、チャネルと細孔に凝集します。それでも、その細孔径は均一ではありません。したがって、結果を再現することは困難です。一方、取り扱いやキャストは簡単です。また、ゲルが冷えるとアガロースが固まります。
ポリアクリルアミドとは
ポリアクリルアミドは、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)の調製に使用される物質です。基本的に、それは2つの分子の架橋の産物です。アクリルアミドおよびビスアクリルアミド。また、アクリルアミドは、酵素ニトリルヒドラターゼによるアクリロニトリルの水和生成物です。これらに加えて、それは人間の神経系に有毒である粉末の形をしています。水を加えると、アクリルアミドは重合してポリアクリルアミドになります。
図2:ページ
アガロースとポリアクリルアミドの類似点
アガロースとポリアクリルアミドの違い
意味
アガロースは、特に電気泳動用のゲルで使用される寒天の主成分です。ポリアクリルアミドは、アクリルアミドを重合して作られた合成樹脂です。これは、安定化されたゲルを形成するために使用される水溶性ポリマーです。
作る
アガロースは海藻に由来する複雑な多糖類であり、アクリルアミドはニトリルヒドラターゼによるアクリロニトリルの消化によって作られます。
構成
アガロースは多くの分子で構成されていますが、ポリアクリルアミドには1つの大きな分子が含まれています。
ジェル
アガロースゲルは、網目構造を形成するために連結された糖の長鎖を含み、ポリアクリルアミドゲルは、アクリルアミドとビスアクリルアミドの化学的架橋を構成し、モレキュラーシーブを生成します。
設定
アガロースは冷えると固まり、ポリアクリルアミドは架橋が起こると化学反応によって固まります。
構成の実行
アガロースは水平ゲルであり、ポリアクリルアミドは垂直ゲルです。
プロパティ
アガロースゲルの細孔径は、ゲル中のアガロースの濃度が高くなるにつれて小さくなります。しかし、ビスアクリルアミドに対するアクリルアミドの比率は、ポリアクリルアミドゲルの細孔径を決定します。
ゲルの典型的な濃度
アガロースゲルの典型的な濃度は約0.5〜2%ですが、ポリアクリルアミドゲルの典型的な濃度は約6〜15%です。
生体分子の分離
アガロースゲルは主にPCR産物などのはるかに大きなDNA断片の分離に重要ですが、ポリアクリルアミドゲルはタンパク質やオリゴヌクレオチド、miRNA、tRNAなどの小さな核酸の分離に重要です。
DNAの分離
アガロースは約50〜20、000 bpのサイズのDNAを分離できますが、ポリアクリルアミドは約5〜500bpのサイズのDNAを分離できます。
解像力
アガロースゲルの分解能は比較的低く、ポリアクリルアミドゲルの分解能は高くなっています。
DNA構成
アガロースゲルは通常、二本鎖の形でDNAを分離しますが、ポリアクリルアミドゲルは一本鎖の形でDNAを分離します。
長所
アガロースゲルは毒性がなく取り扱いが簡単ですが、ポリアクリルアミドゲルは再現性のある結果をもたらします。
短所
アガロースゲルは均一な孔径を持っていませんが、ポリアクリルアミドゲルは強力な神経毒を含んでいます。
結論
アガロースは、主にDNAの大きな断片を分離するためのゲルの製造に重要な海藻の多糖類です。また、解像力が比較的低い横型ゲルです。一方、ポリアクリルアミドは、主にタンパク質の分離に使用される別のタイプのゲルです。また、分解能が高いため、小さな核酸の分離にも重要です。それに加えて、化学反応によるアクリルアミドとビスアクリルアミドの架橋で構成されています。一方、ポリアクリルアミドは垂直ゲルです。したがって、アガロースとポリアクリルアミドの主な違いは、組成、硬化、および分解能です。
参照:
1.クローア、アダム。 「アガロースおよびポリアクリルアミドゲルの実行。」 Integrated DNA TECHNOLOGIES、Integrated DNA Technologies、Inc.、2017年9月20日。こちらから入手できます。
画像提供:
1.「電気泳動–ゲルに沿って移動」マイケル–コモンズウィキメディア経由で移動(CC BY 2.0)2。コモンズウィキメディア経由で「Gelelektrophoreseapparatur」(CCBY-SA 3.0)
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