イルミナのシーケンスはどのように機能しますか
目次:
イルミナシーケンスは次世代のシーケンス方法であり、「合成によるシーケンシング" 方法。イルミナのシーケンスは、何百万ものフラグメントを並行して処理することに関係しています。イルミナのシーケンスワークフローに含まれる4つの基本的なステップは、ライブラリの準備、クラスターの生成、シーケンス、およびデータ分析です。これらについては、この記事で詳しく説明します。
対象となる主要分野
1.イルミナシーケンシングとは –定義、事実、利点 2.イルミナのシーケンスはどのように機能しますか –イルミナシーケンスのプロセス:–ライブラリーの準備–クラスター生成–シーケンス–データ分析
重要な用語:クラスター生成、データ分析、イルミナシーケンス、ライブラリー調製、合成によるシーケンス
イルミナシーケンスとは
イルミナのシーケンシングまたは合成によるシーケンシング(SBS)テクノロジーは、世界で最も広く使用されている次世代シーケンシングテクノロジーです。世界のシーケンスデータの90%以上は、イルミナのシーケンスによって生成されています。もともとはケンブリッジ大学のShankarBalasubramanianとDavidKlenermanによって開発されました。彼らは1998年にSolexaとして知られる会社を設立しました。その後、イルミナは2007年にSolexaを購入し、元の技術を急速に改善しました。したがって、このメソッドは Solexa / Illuminaシーケンス方式。イルミナシーケンスの主な利点は、エラーのない読み取りを高収率で実現できることです。
イルミナのシーケンスはどのように機能しますか
イルミナのシーケンスに含まれる4つのステップを以下に説明します。
ステップ1.ライブラリの準備
図1:モチーフのタグ付けと追加
ステップ2.クラスターの生成
図2:フローセル
図3:クローン増幅
ステップ3.シーケンス
逆シーケンスの最初の読み取り
図4:合成によるシーケンス
インデックス1読み取り
インデックス2読み取り
フォワードシーケンスの2回目の読み取り
ステップ4.データ分析
次のビデオでは、イルミナのシーケンスの完全なプロセスについて説明しています。
結論
イルミナのシーケンスは、次世代のシーケンス手法です。イルミナのシーケンシングは、200〜600塩基対の長さのDNA断片を含むシーケンシングライブラリの準備に関与しています。イルミナのシーケンスに含まれる4つのステップは、ライブラリの準備、クラスターの生成、シーケンス、およびデータ分析です。イルミナシーケンシングは高精度のシーケンスリードを提供するため、世界中で広く使用されているシーケンシング方法です。
リファレンス:
1.「SequencingbySynthesis(SBS)テクノロジー」。シーケンシングテクノロジー|合成によるシーケンシング、こちらから入手できます。
画像提供:
1. DMLapatoによる「DNA処理の準備」– Commons Wikimediaによる自作(CC BY-SA 4.0)2。DMLapatoによる「フローセル内のオリゴヌクレオチド鎖」– Commons Wikimediaによる自作(CC BY-SA 4.0)3。「合成によるシーケンスリバーシブルターミネーター」AbizarLakdawalla(トーク)– Commons Wikimedia 4を介してこの作品を完全に自分で作成しました(CC BY-SA 3.0)。DMLapatoによる「クラスター生成」– Commonsを介した独自の作品(CC BY-SA 4.0)ウィキメディア