プロテオミクスとトランスクリプトミクスの違い
目次:
NS 主な違い プロテオミクスとトランスクリプトミクスの間には、 プロテオミクスは特定の生物によって生成されたタンパク質のセット全体の研究であるのに対し、トランスクリプトミクスは特定の生物によって合成されたmRNAのセット全体の研究です.
プロテオミクスとトランスクリプトミクスは、特定の生物の遺伝子発現が研究されている2つの分野です。
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プロテオミクスとは
プロテオミクスは、プロテオームの大規模な研究です。プロテオームとは、特定の生物または細胞によって産生されるタンパク質のセット全体を指します。したがって、特定の種類の生物または細胞には固有のプロテオームがあります。プロテオミクスの主な調査分野は次のとおりです。
プロテオミクス研究には、質量分析やディファレンスゲル電気泳動(DIGE)などのいくつかのハイスループット技術が関与しています。
トランスクリプトミクスとは
トランスクリプトミクスは、特定の生物または細胞のトランスクリプトームの研究です。トランスクリプトームとは、生物または細胞内のmRNAのセット全体を指します。ただし、RNAのセット全体を指すこともあります。トランスクリプトームは、生物または細胞が直面しなければならない環境条件によって異なります。したがって、特定の条件下で定義された時間に発現されたRNAのセットを反映します。トランスクリプトミクスには、発現プロファイリングとスライスバリアント分析の両方の調査が含まれます。 DNAマイクロアレイとRNASeqは、トランスクリプトミクスで使用される2つの主要なテクノロジーです。
図2:マイクロアレイとRNAシーケンス
プロテオミクスとトランスクリプトミクスの類似点
プロテオミクスとトランスクリプトミクスの違い
意味
プロテオミクスはプロテオームとその機能の研究を指し、トランスクリプトミクスはトランスクリプトームとその機能の研究を指します。
研究の種類
プロテオミクスは発現されたタンパク質のセット全体を研究し、トランスクリプトミクスは特定の生物で発現されたmRNAのセット全体を研究します。
現象
プロテオミクスはタンパク質の3D構造と機能、およびタンパク質間相互作用を研究し、トランスクリプトミクスは配列構造、環境との相互作用、およびmRNAの応用を研究します。
テクニック
プロテオミクスには質量分析とディファレンスゲル電気泳動(DIGE)が含まれ、トランスクリプトミクスには技術としてDNAマイクロアレイとRNASeqが含まれます。
重要な分野
プロテオミクスの重要な分野のいくつかは、SWISS-2DPAGEやコンピューター支援ドラッグデザインのためのソフトウェア開発などのプロテオームデータベース開発であり、トランスクリプトミクスは、細胞分化、発癌、分子メカニズム、および初期胚発生を制御するシグナル伝達経路の研究に関与します。薬物または化学物質のリスク評価のためのバイオマーカー、および個人間の系統発生的関係の推測。
結論
プロテオミクスは特定の生物のタンパク質のセット全体の研究であり、トランスクリプトミクスは生物のmRNAのセット全体の研究です。したがって、プロテオミクスとトランスクリプトミクスの主な違いは、研究の種類です。
リファレンス:
1.「プロテオミクスとは」プロテオミクス:EMBL-EBIリソースの概要、2016年6月8日、こちらから入手可能2。 Lowe、Rohan etal。 「トランスクリプトミクステクノロジー」。 PLoS Computational Biology 13.5(2017):e1005457。 PMC。ウェブ。 2018年7月10日、こちらから入手可能
画像提供:
1.「タンパク質構造の例」AxelGriewel著– Commons Wikimedia2による自作(CC BY-SA 3.0)。 「マイクロアレイとシーケンスフローセル」ThomasShafee著– Commons Wikimediaによる自作(CC BY 4.0)