ゲル電気泳動とSDSPAGEの違い

NS 主な違い ゲル電気泳動とSDSPAGEの間はゲル電気泳動は、DNA、RNA、およびタンパク質を分離するために使用される技術ですが、SDS PAGEは、主にタンパク質を分離するために使用されるゲル電気泳動の一種です。一般的に、SDSPAGEは通常のゲル電気泳動よりも優れた解像度を提供します。

ゲル電気泳動とSDSPAGEは、電荷とサイズに基づいて高分子を分離するのに役立つバイオテクノロジーの手法です。通常、ゲル電気泳動では分離にアガロースゲルスタブを使用しますが、SDSPAGEではポリアクリルアミドゲルスタブを使用します。

対象となる主要分野

1.ゲル電気泳動とは –定義、手順、重要性 2.SDSページとは –定義、手順、重要性 3.ゲル電気泳動とSDSPAGEの類似点は何ですか –共通機能の概要 4.ゲル電気泳動とSDSPAGEの違いは何ですか –主な違いの比較

重要な用語：アガロース、DNA、ゲル電気泳動、ポリアクリルアミド、タンパク質、SDS PAGE

ゲル電気泳動とは

ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの高分子の断片を、そのサイズと電荷に基づいて分離する手法です。ゲル電気泳動中、高分子は、高分子が移動する細孔を含むゲルマトリックス上の電界の影響下で移動します。ゲル電気泳動は、PCR、RFLP、クローニング、DNAシーケンシング、またはブロッティング技術からDNAを分析する一般的な技術です。ナノ粒子は、ゲル電気泳動によっても分離できます。ゲルスタブは、海藻由来のアガロースと呼ばれる多糖類から作られています。アガロースゲルは、クモの巣として連結された長鎖アガロース分子で構成されています。ビデオ1では、アガロースゲルの調製について説明しています。

DNAとRNAはどちらも、それぞれのモノマーヌクレオチドにリン酸基を含んでいます。したがって、それらは分子全体で等しい負電荷を持っています。さらに、それらは電界下で正極に向かって移動します。移動の速度は、核酸のサイズに依存します。短い分子は細孔内をより速く移動しますが、大きな分子は時間がかかります。

図1：アガロースゲル上のDNAバンド

SDSPAGEとは

SDS PAGE（ドデシル硫酸ナトリウム-ポリアクリルアミドゲル電気泳動）は、サイズに基づいて荷電分子を分離するために使用される分析技術です。このプロセスでは、SDSを使用してタンパク質を変性させて単離します。 SDSは洗剤なので;タンパク質の三次構造はそれによって破壊され、折りたたまれたタンパク質を線状分子に落とします。また、その線状タンパク質分子を均一な負電荷でコーティングします。 SDS PAGEは、濃度の異なる2つのゲルで構成されています。上層はサンプルがロードされるスタッキングゲルと呼ばれ、下層は分離ゲルと呼ばれます。スタッキングゲルのポリアクリルアミド濃度は3.5〜4％（大きなポアサイズ）で、タンパク質を1つのバンドに濃縮します。分離ゲル中のポリアクリルアミド濃度は4〜20％（小さなポアサイズ）であり、サイズに基づいてタンパク質を分離します。ビデオ2は、SDSPAGEの準備を示しています。

SDS PAGEはタンパク質の迅速な分離を提供し、ウエスタンブロッティングなどのその後の分析を支援します。

図2：SDSページのタンパク質バンド

SDS PAGEの分解能は通常のアガロースゲルよりも高いため、SDS PAGEはサイズが5〜500bpの小さなDNAフラグメントを分離するのに役立ちます。

ゲル電気泳動とSDSPAGEの類似点

ゲル電気泳動とSDSPAGEの違い

意味

ゲル電気泳動： サイズと電荷に基づいて、DNA、RNA、タンパク質などの高分子のフラグメントを分離するために使用される手法

SDSページ： サイズに基づいて荷電分子を分離するために使用される分析技術

構成

ゲル電気泳動： ゲル全体で等しい。アガロースでできています

SDSページ： 濃度の異なる2つのゲル。ポリアクリルアミドで構成されています

構成の実行

ゲル電気泳動： 横走

SDSページ： 垂直走行

鋳造方法論

ゲル電気泳動： 冷えるとセット

SDSページ： 化学反応による硬化

細孔径

ゲル電気泳動： 細孔径は均一ではありません。アガロース濃度が高いほど、細孔径は小さくなります

SDSページ： 細孔径は均一です。アクリルアミドとビスアクリルアミドの比率が細孔径を決定します

集中

ゲル電気泳動： 0.5-2%

SDSページ： 6-15%

分離

ゲル電気泳動： 50〜20、000bpの核酸

SDSページ： 5〜250、000Daのタンパク質

条件

ゲル電気泳動： 通常、ネイティブ条件下で実行されます

SDSページ： 変性条件

準備

ゲル電気泳動： 単純

SDSページ： 複雑なプロセス

染色

ゲル電気泳動： 臭化エチジウムを使用

SDSページ： クマシー染色または銀染色

結論

ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの高分子をサイズに基づいて分離する分析技術です。 SDS PAGEは、主に変性条件下でタンパク質を分離するために使用されるゲル電気泳動の一種です。 SDS PAGEは、通常のゲル電気泳動と比較して高い分解能を持っています。ゲル電気泳動とSDSPAGEの主な違いは、分離された高分子の種類とその手順です。