アミノ酸配列を見つける方法

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アミノ酸とは

アミノ酸は私たちの体のすべてのタンパク質の基本的な構成要素です。それがホルモン、酵素、ケラチンのような構造タンパク質であるかもしれません、これらはすべてアミノ酸で構成されています。アミノ酸は重合してタンパク質を生成します。すべてのアミノ酸には塩基性の–NH2末端と酸性の–COOH末端があるため、これらの末端は互いに反応して、ポリペプチドと呼ばれるアミノ酸の鎖を形成します。ポリペプチドは、様々なアミノ酸を含み得る。アミノ酸配列としても知られるアミノ酸の順序によっては、タンパク質が互いに異なる場合があります。シーケンシングは、タンパク質が適切に機能するかどうかを決定するため、最も重要です。

アミノ酸はランダムに重合しません。このプロセスは厳しく規制されています。各タンパク質のコードは、最初にm-RNA配列に転写されるDNA配列に保存され(高等生物では、遺伝子間にある不要なDNA配列が除去されるm-RNAに変換される前にDNAがスプライシングされます)、次にm- RNAはアミノ酸配列に翻訳されます。

(A =アデニン、T =チミン、G =グアニン、C =シトシン、U = m-RNAのウラシルtはUに置き換えられます)

DNAを4文字のアルファベットと見なし、3文字の単語を作成できる場合、これらの3文字の単語はコドンと呼ばれます。これらのコドンはそれぞれ、特定のアミノ酸を表しています。したがって、DNA配列またはm-RNA配列が提供されている場合、アミノ酸配列を予測できる可能性があります。本当の問題は、DNAは情報の線形配列であるため、正しい位置で開始および停止するためのいくつかのルールが必要であるということです。

アミノ酸配列を見つけるためのいくつかのステップ

ステップ1 –どのDNA鎖が与えられているかを知る。 2つのストランドがあります:コーディングストランドまたは非コーディングストランド。

対応するm-RNA鎖を作成するときに、コーディング鎖を3 'から5'に読み取るか、テンプレート鎖を5 'から3'に読み取ることができます。

ステップ2 –対応するm-RNA鎖を記述します。

コーディングストランドの使用:(A = U、T = A、G = C、C = G)左から右に読み取ります

テンプレート鎖の使用:(T = U)左から右に読む

使用するストランドに関係なく、同じシーケンスを達成していることがわかります。

ステップ3 –m-RNAを一連のコドンとして変換します。常にコドンAUGから開始し、同じヌクレオチドを2回カウントしないでください。

ステップ4 –以下の表を使用して、関連するアミノ酸配列を見つけます。

また、覚えておいてください。開始コドンAUGはメチオニンの略です。 NS。終止コドンUAA、UGA、UAGに遭遇した場合は、シーケンスを停止する必要があります。

以下に示す答えが得られるかどうかを確認してください。

Met- Leu- Asp- Val- Phe-STOP

アミノ酸配列を見つける方法