ゲノミクスとプロテオミクスの違い

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主な違い–ゲノミクスとプロテオミクス

ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクスは、それぞれ、ゲノム、遺伝的指示に基づいて合成されたタンパク質産物、およびそれらが代謝する分子の種類による生物の研究と分類に関与する分野です。ゲノミクスとプロテオミクスは密接に関連した分野です。 NS 主な違い ゲノミクスとプロテオミクスの間は ゲノミクスは細胞のゲノム内の遺伝子の全セットの研究であるのに対し、プロテオミクスは細胞によって産生されるタンパク質の全セットの研究です。一方、メタボロミクスは、細胞の酵素反応の基質および副産物として機能する低分子量化合物のセット全体の研究です。

対象となる主要分野

1.ゲノミクスとは –定義、テクニック、分類 2.プロテオミクスとは –定義、テクニック、分類 3.ゲノミクスとプロテオミクスの類似点は何ですか –共通機能の概要 4.ゲノミクスとプロテオミクスの違いは何ですか –主な違いの比較

重要な用語:遺伝子、ゲノミクス、ヒトゲノムプロジェクト(HGP)、ヒトプロテオームプロジェクト(HPP)、タンパク質、プロテオーム、プロテオミクス

ゲノミクスとは

ゲノミクスとは、ゲノム内の遺伝子セット全体の研究を指します。ゲノムは、主にDNAで構成された、生物の遺伝情報の完全なセットです。ハイスループット技術は、ゲノムをマッピング、配列決定、および分析するためにゲノミクスで使用されます。ゲノミクスに関連する技術には、有向遺伝子シーケンシング、全ゲノムショットガンシーケンシング、発現配列タグ(EST)の構築、単一ヌクレオチド多型(SNP)の識別、さまざまなソフトウェアを使用したシーケンシングデータの分析と解釈などの遺伝子シーケンシング戦略が含まれます。データベース。ショットガンシーケンスの主な手順を図1に示します。

図1:環境ショットガンシーケンス(ESS)サンプリング、(B)粒子のフィルタリング、(C)DNA抽出と溶解、(D)クローニングとライブラリー、(D)シーケンス、(E)シーケンスアセンブリ

ゲノミクスの2つの主要な領域は、構造ゲノミクスと機能ゲノミクスです。の 構造ゲノミクス、遺伝子の構造と相対的な位置は、 機能ゲノミクス、代謝活性の調節における遺伝子の機能または役割が研究されています。ゲノムシーケンシングプロジェクトは、ゲノミクスの最新の開発です。ヒトゲノムプロジェクト(HGP)は2003年に完了しました。ヒトゲノムプロジェクトの目標は次のとおりです。

ヒトゲノムに加えて、マウスとイネのゲノムもゲノム研究の対象となっています。

プロテオミクスとは

プロテオミクスとは、細胞によって生成されるタンパク質のセット全体の研究を指します。プロテオームは、細胞によって生成されるタンパク質の完全なセットです。プロテオミクスでは、タンパク質の3D構造と機能の特性評価は、ハイスループット法を使用して実行されます。プロテオミクスに関連する技術には、タンパク質の抽出と電気泳動分離、トリプシンを使用したタンパク質の小さな断片への消化、質量分析によるアミノ酸配列の決定、およびタンパク質データベースの情報を使用したタンパク質の同定が含まれます。さらに、タンパク質の3D構造は、ソフトウェアベースの方法を使用して予測できます。タンパク質の発現は、タンパク質マイクロアレイによって研究することができます。タンパク質ネットワークマップは、タンパク質間相互作用を決定するために開発することができます。プロテオミクスのさまざまな現象を図2に示します。

図2:プロテオミクス

ヒトゲノムの遺伝子のタンパク質産物は、Human Proteome Project(HPP)で研究されています。ヒトプロテオームプロジェクトの主な目的の1つは、主要な疾患に関与するタンパク質を特定することです。

ゲノミクスとプロテオミクスの類似点

ゲノミクスとプロテオミクスの違い

意味

ゲノミクス: ゲノミクスとは、ゲノム内の遺伝子セット全体の研究を指します。

プロテオミクス: プロテオミクスとは、細胞によって生成されるタンパク質のセット全体の研究を指します。

現象

ゲノミクス: ゲノミクスには、ゲノムのマッピング、配列決定、および分析が含まれます。

プロテオミクス: プロテオミクスには、タンパク質の3D構造と機能、およびタンパク質間相互作用が含まれます。

分類

ゲノミクス: ゲノミクスには、構造ゲノミクスと機能ゲノミクスの2種類があります。

プロテオミクス: 3種類のプロテオミクスは、構造的、機能的、および発現プロテオミクスです。

重要な分野

ゲノミクス: ヒトゲノムプロジェクトなどのゲノムシーケンシングプロジェクトは、ゲノミクスの重要な分野です。

プロテオミクス: SWISS-2DPAGEなどのプロテオームデータベースの開発やコンピューター支援ドラッグデザインのソフトウェア開発は、プロテオミクスの重要な分野です。

結論

ゲノミクスとプロテオミクスは、生物の研究で使用される2つの科学分野です。ゲノミクスは生物の遺伝子の全セットの研究であるのに対し、プロテオミクスは細胞によって生成されるタンパク質の全セットの研究です。ゲノミクスとプロテオミクスの主な違いは、生物の研究中の各分野の基準です。

リファレンス:

1.グリフィス、アンソニーJF。 「ゲノミクス:概要」遺伝分析入門。第7版、米国国立医学図書館、1970年1月1日、こちらから入手可能2。無限。 「ゲノミクスとプロテオミクス。」ゲノミクスとプロテオミクス|無限の生物学、ここで入手可能3。グレイブス、ポールR.、およびティモシーA.J.ヘイステッド。 「分子生物学者のプロテオミクスガイド」。微生物学および分子生物学のレビュー、米国微生物学会、2002年3月、ここで入手可能。

画像提供:

1.「環境ショットガンシーケンス」JohnC。Wooley、Adam Godzik、Iddo Friedberg –(CC BY 2.5)CommonsWikimedia2経由。英語ウィキブックスのXxl7441による「プロテオミクス」–en.wikibooksからコモンズに転送されました。 (パブリックドメイン)コモンズウィキメディア経由

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